De maneira geral, a amostragem de agua superficial e residuais, é a primeira etapa da análise de um ambiente. O objetivo desse serviço é coletar pequenas amostras, para que sejam transportadas para o laboratório e preservadas corretamente.

A amostragem ambiental pode ser feita em diversos tipos de ambientes, como: rios, riachos, lagoas, lagos, córregos, reservatórios, e o oceano, e também efluentes. Por ser a base da análise, é imprescindível que a amostragem seja feita com excelência e por profissionais especialistas. Os resultados obtidos no monitoramento das águas são comparados com os respectivos padrões de qualidade das classes de enquadramento, de cada corpo de água.